Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms