Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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