Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.3 ms