Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBQLN4Q9NRR5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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