Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SEMA4BQ9NPR2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEMA4BQ9NPR2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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