Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PREBQ9HCU5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms