Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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