Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GSDMCQ9BYG8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms