Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VN1R3Q9BXE9 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms