Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB2BQ9BVA1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms