Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KATNB1Q9BVA0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms