Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms