Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFHD1Q9BUP0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms