Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MESP1Q9BRJ9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms