Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
AKAP9Q99996 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms