Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms