Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIN3AQ96ST3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms