Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT140Q96RY7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT140Q96RY7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms