Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PCNX1Q96RV3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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