Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SERAC1Q96JX3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms