Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RNFT2Q96EX2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RNFT2Q96EX2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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