Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPBP1Q92547 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms