Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBA3Q8TBC4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBA3Q8TBC4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBA3Q8TBC4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBA3Q8TBC4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBA3Q8TBC4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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UBA3Q8TBC4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBA3Q8TBC4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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