Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHDC4Q8TBB5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms