Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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