Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNTD2Q8IXW0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms