Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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