Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms