Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms