Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms