Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms