Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PERM1Q5SV97 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms