Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCID2Q5JVF3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms