Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC93Q567U6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms