Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PDLIM3Q53GG5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PDLIM3Q53GG5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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