Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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CTXN3Q4LDR2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTXN3Q4LDR2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms