Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms