Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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RTL8BQ17RB0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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