Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HADHQ16836 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HADHQ16836 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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