Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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