Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNGA3Q16281 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNGA3Q16281 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNGA3Q16281 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNGA3Q16281 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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CNGA3Q16281 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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