Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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E2F4Q16254 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F4Q16254 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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