Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TWIST1Q15672 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms