Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED1Q15648 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED1Q15648 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED1Q15648 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED1Q15648 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED1Q15648 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED1Q15648 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MED1Q15648 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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