Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRKQ15262 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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