Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLD3Q15054 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLD3Q15054 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms