Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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RFTN1Q14699 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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RFTN1Q14699 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RFTN1Q14699 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN1Q14699 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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