Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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