Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TUBA3CQ13748 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TUBA3CQ13748 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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