Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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